皇太极下令停止进攻松山，后金军返回盛京。于是祖大寿又进入锦州驻守。
1640年，皇太极到义州视察，蒙古苏班岱等请求归降，皇太极命济尔哈朗等率军一千五百人前去迎接。祖大寿得知清军人少，命令游击戴明与松山总兵吴三桂、杏山总兵刘周智合兵七千人出击，却被济尔哈朗打败。
于是皇太极命多尔衮、济尔哈朗等带兵轮番攻锦州。
1642年农历三月初，被围困了整整一年的锦州粮绝援尽，城中杀人相食的惨状再度重演，惨不忍睹。
祖大寿为了保全城中人的性命，在三月初八亲率部众开城出降。
消息传到盛京，皇太极大喜过望，命人立刻将祖大寿送到盛京。
皇太极一直想招降祖大寿和吴三桂。但是祖大寿投降满清之后，却一直沉默不言，没给满清献一计，更不用说替他们打仗。
皇太极竟然也宽宏大量，没有杀祖大寿。
听说吴应熊想要回祖大寿，大玉儿有点不愿意，说：”镶蓝旗真的抵挡不住明军三天了么？“
济尔哈朗说：”明军的火力比以前猛了不少，这几天镶蓝旗损失惨重。为了确保盛京万无一失，还请皇太后明察。“
大玉儿虽然有才，但不懂得军事打仗，她有点担心儿子福临的安危，说：“既然如此，那就就这么办吧。”
就这样，祖大寿回到了阔别已久的明朝，他和亲人们再次回到锦州，感慨不已。
吴三桂得知此喜讯，亲自赶到关外的锦州迎接祖大寿。
祖大寿归来，关宁军上下也一片欢呼，士气大振。祖大寿虽然已经离开了关宁军好几年，但他是这支军队的创始人，依然是关宁军的精神教父。